
<!DOCTYPE html PUBLIC "-//W3C//DTD HTML 4.01 Transitional//EN">

<html>

<head>

</head>

<body bgcolor="#ffffff" text="#000000">

Dear,<br>

I am looking for a conversion table that links some gene_IDs mentioned

in the GO association file (<a class="moz-txt-link-freetext"

 href="http://geneontology.org">http://geneontology.org</a> ; Downloads

; Annotations ; Oryza sativa) to locus names provided in the TIGR

annotation.<br>

<br>

<u>for example we have:</u><br>

<small></small>

<blockquote><i><b>gene_association.gramene_oryza</b><br>

  <small>CVS Version: Revision: 1.49 </small><br>

  <small>GOC Validation Date: 05/03/2008 </small><br>

  <small>Submission Date: 9/19/2007</small></i><br>

</blockquote>

<small><i>GR_protein&nbsp;&nbsp;&nbsp; P35683&nbsp;&nbsp;&nbsp; <b><font color="#006600">Os06g0701100,

LOC_Os06g48750</font>&nbsp;&nbsp;&nbsp; </b>&nbsp;&nbsp;&nbsp; GO:0003676&nbsp;&nbsp;&nbsp; GR_REF:8030&nbsp;&nbsp;&nbsp; RCA&nbsp;&nbsp;&nbsp;

InterPro:IPR001650|InterPro:IPR000629&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp; Eukaryotic initiation

factor 4A&nbsp;&nbsp;&nbsp; eIF-4A|eIF4A&nbsp;&nbsp;&nbsp; protein&nbsp;&nbsp;&nbsp; taxon:4530&nbsp;&nbsp;&nbsp; 20060831&nbsp;&nbsp;&nbsp; GR <br>

GR_protein&nbsp;&nbsp;&nbsp; Q9AVL8&nbsp;&nbsp;&nbsp; <font color="#cc0000"><b>OsRPA70a</b>&nbsp;</font>&nbsp;&nbsp;

&nbsp;&nbsp;&nbsp; GO:0003676&nbsp;&nbsp;&nbsp; GR_REF:8030&nbsp;&nbsp;&nbsp; RCA&nbsp;&nbsp;&nbsp; InterPro:IPR004365&nbsp;&nbsp;&nbsp; F&nbsp;&nbsp;&nbsp;

Replication protein A 70kDa&nbsp;&nbsp;&nbsp; &nbsp;&nbsp;&nbsp; protein&nbsp;&nbsp;&nbsp; taxon:4530&nbsp;&nbsp;&nbsp; 20060831&nbsp;&nbsp;&nbsp;

GR </i><br>

<br>

</small>So how can I find the LOC_ID corresponding to "<small><font

 color="#cc0000"><b>OsRPA70a</b></font>" ?</small><br>

Is there any conversion table available?<br>

<br>

Thanks,<br>

Sara<br>

<pre class="moz-signature" cols="72">-- 

==================================================================

Sara Movahedi 


Tel:+32 (0)9 331 38 22                        fax:+32 (0)9 3313809

VIB Department of Plant Systems Biology, Ghent University

Technologiepark 927, 9052 Gent, BELGIUM

<a class="moz-txt-link-abbreviated" href="mailto:samov@psb.ugent.be">samov@psb.ugent.be</a>                         <a class="moz-txt-link-freetext" href="http://www.psb.ugent.be">http://www.psb.ugent.be</a>

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</pre>

</body>

</html>