<!doctype html public "-//W3C//DTD W3 HTML//EN">
<html><head><style type="text/css"><!--
blockquote, dl, ul, ol, li { padding-top: 0 ; padding-bottom: 0 }
--></style><title>Re: Data for a mapping
population</title></head><body>
<div>Hi Adam,</div>
<div><br></div>
<div>It was nice to catch site of you at PAGXI, however briefly.</div>
<div><br></div>
<div>Thank you very much for this communication about the mapping data
from your drought QTL work on the Bala x Azucena population. We
are currently altering our data models and database schema to be able
to store and provide access to raw mapping data files. </div>
<div><br></div>
<div>Do you still have the raw data that was used to map the QTLs?
If so, we are interested in offering it a home within Gramene.
If you agree to donate that data, it would be one of the first
submissions of raw marker and phenotype data to a public database.
We aim to establish collaborations with authors of QTL papers so that
they can help annotate their work for submission to our database in
the future. We have only begun to develop the process that will
facilite this kind of relationship, but we would be interested in
working with you to improve and streamline a mechanism for:</div>
<div><br></div>
<div>a) submission of raw data</div>
<div>b) author-based extraction of information from your published
work to be integrated into Gramene</div>
<div>c) final quality-check on curated information that you have
donated, once the Gramene curators have made all the internal and
external links required for full functionality to query the
information you have donated.</div>
<div><br></div>
<div>Please let us know if you are interested in working with us on
these points, and if you have the original, raw mapping scores for
both markers and phenotypes (in each environment), please let us know
if you are willing to make those public.</div>
<div><br></div>
<div>We are very happy to hear from you and look forward to working
with you to get your data integrated into our database.</div>
<div><br></div>
<div>Best regards,<br>
Susan</div>
<div><br></div>
<div><br></div>
<div><br></div>
<div><br></div>
<blockquote type="cite" cite>Dear Gramene,<br>
<br>
Contained below this email and as a Word attachment are details of
mapping data on the Bala x Azucena mapping population of rice that I
have been using for QTL mapping drought traits. I email it to
you in the hope that it might be interesting for you to include it in
the web site. Please let me know if it is interesting, if you
will use it, if you need it in another format or if there is other
information regarding the population tht would be useful.<br>
<br>
Yours sincerely,<br>
<br>
<br>
Adam Price<br>
<br>
------------------------------------------------<br>
The mapping population is an F6 recombinant inbred population derived
from a cross between rice (<i>Oryza sativa</i>) varieties Bala and
Azucena. 205 lines were evaluated, using a LOD threshold of 3.0. The
map now contains 102 (RGP and Cornell) RFLP, 35 AFLP and 17
microsatellites markers. The original version of the map was
published in Price et al. (2000) TAG 100:49-56 (2000). To date the
population has been used to identify QTLs for root penetration ability
(Price et al. 2000, TAG 100:49-56), root morphological traits (Price
et al. 2002, Field Crops Research 76: 25-43) and drought avoidance in
the field (Price et al. 2002 Plant Molecular Biology 48: 683-695).<br>
<br>
The map as produced in mapmaker is given below. Note:<br>
1/ Here are presented the distance between markers (3<font
size="-2">rd</font> column) and the distance from the top of the
chromosome. <br>
2/ Chromosome 12 is split into two linkage groups (12t and 12b).<br>
3/ AFLP markers are named by the EcoR1 primer (e.g. E12) followed by
the Mse primer (e.g. M36) followed by a full stop and a number
representing the order of the polymorphic bands from the top of the
gel; e.g. E18M43.7 was the 7<font size="-2">th</font> polymorphic band
from the top of the gel using the EcoR1 primer 18 and Mse primer
43.<br>
4/ Two gaps exceed the 40 cM threshold (on chromosomes 2 and 6) but
these markers are linked due to reasonably high LOD scores and known
marker positions.<br>
<br>
<font
face="Courier New"
>=====================================================================<x-tab
>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c1<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>23<x-tab>
</x-tab>RG532<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>28.4<x-tab> </x-tab>0<br>
<x-tab>
</x-tab>8<x-tab>
</x-tab>RG173<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>8<x-tab> </x-tab>28.4<br>
<x-tab> </x-tab>37<x-tab>
</x-tab>RZ995<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>11.1<x-tab> </x-tab>36.4<br>
<x-tab> </x-tab>160<x-tab>
</x-tab>E18M43.7<x-tab>
</x-tab>12.3<x-tab> </x-tab>47.5<br>
<x-tab> </x-tab>159<x-tab>
</x-tab>E18M43.6<x-tab>
</x-tab>7.6<x-tab> </x-tab>59.8<br>
<x-tab> </x-tab>146<x-tab>
</x-tab>E12M45.4<x-tab>
</x-tab>1.9<x-tab> </x-tab>67.4<br>
<x-tab> </x-tab>45<x-tab>
</x-tab>C178<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>22<x-tab> </x-tab>69.3<br>
<x-tab> </x-tab>249<x-tab>
</x-tab>RM5<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.7<x-tab> </x-tab>91.3<br>
<x-tab> </x-tab>106<x-tab>
</x-tab>R2635<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>33.5<x-tab> </x-tab>94<br>
<x-tab>
</x-tab>239<x-tab> </x-tab>RM246<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.9<x-tab> </x-tab>127.5<br>
<x-tab> </x-tab>63<x-tab>
</x-tab>C1370<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>6.8<x-tab> </x-tab>142.4<br>
<x-tab> </x-tab>81<x-tab>
</x-tab>G393<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>1.4<x-tab>
</x-tab>149.2</font></blockquote>
<blockquote type="cite" cite><font
face="Courier New"><x-tab>
</x-tab>105<x-tab> </x-tab>R2417<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>23.8<x-tab> </x-tab>150.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>241<x-tab> </x-tab>RM212<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>23.6<x-tab> </x-tab>174.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>43<x-tab>
</x-tab>C86<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>19.3<x-tab>
</x-tab>198<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>60<x-tab>
</x-tab>C949<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>0.7<x-tab> </x-tab>217.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>30<x-tab>
</x-tab>RZ14<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>32.8<x-tab>
</x-tab>218<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>90<x-tab>
</x-tab>R117<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>250.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>250.5<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>18<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-597.94<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
c2<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>21<x-tab>
</x-tab>RG509<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>20.1<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>3<x-tab>
</x-tab>RG83<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>34.4<x-tab> </x-tab>20.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>7<x-tab>
</x-tab>RG171<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>42.5<x-tab> </x-tab>54.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>68<x-tab>
</x-tab>G45<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>18.9<x-tab>
</x-tab>97<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>161<x-tab>
</x-tab>E18M43.8<x-tab>
</x-tab>16.4<x-tab> </x-tab>115.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>66<x-tab>
</x-tab>G39<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab>132.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>5<x-tab>
</x-tab>RG139<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>3.2<x-tab> </x-tab>132.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>254<x-tab> </x-tab>RM221<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5.3<x-tab> </x-tab>135.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>69<x-tab>
</x-tab>G57<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>11.4<x-tab> </x-tab>140.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>250<x-tab>
</x-tab>RM6<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5<x-tab>
</x-tab>152.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>54<x-tab>
</x-tab>C601<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>35.7<x-tab> </x-tab>157.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>13<x-tab>
</x-tab>RG256<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>192.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>192.8<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>12<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-432.44<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c3<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>132<x-tab>
</x-tab>E12M37.4<x-tab>
</x-tab>26.5<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>56<x-tab>
</x-tab>C643<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.7<x-tab>
</x-tab>26.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>19<x-tab>
</x-tab>RG409<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>11.7<x-tab> </x-tab>29.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>11<x-tab>
</x-tab>RG191<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>33.1<x-tab> </x-tab>40.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>143<x-tab>
</x-tab>E12M45.1<x-tab>
</x-tab>18<x-tab>
</x-tab>74<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>28<x-tab>
</x-tab>RG745<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>10<x-tab>
</x-tab>92<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>118<x-tab>
</x-tab>E12M36.10<x-tab>
</x-tab>5.1<x-tab>
</x-tab>102<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>75<x-tab>
</x-tab>G144<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>12.2<x-tab> </x-tab>107.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>125<x-tab>
</x-tab>E12M36.16<x-tab>
</x-tab>22.6<x-tab> </x-tab>119.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>34<x-tab>
</x-tab>RZ474<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.1<x-tab> </x-tab>141.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>44<x-tab>
</x-tab>C136<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>32.9<x-tab>
</x-tab>156<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>101<x-tab> </x-tab>R1618<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>25.5<x-tab> </x-tab>188.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>76<x-tab>
</x-tab>G164<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>214.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>214.6<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>13<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-525.89<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c4<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>169<x-tab>
</x-tab>E18M43.17<x-tab>
</x-tab>14.6<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>10<x-tab>
</x-tab>RG190<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>12<x-tab>
</x-tab>14.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>58<x-tab>
</x-tab>C734<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>6.7<x-tab>
</x-tab>26.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>20<x-tab>
</x-tab>RG449<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>37<x-tab>
</x-tab>33.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>53<x-tab>
</x-tab>C513<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>13.6<x-tab> </x-tab>70.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>235<x-tab> </x-tab>RM252<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>10.7<x-tab> </x-tab>83.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>6<x-tab>
</x-tab>RG163<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>39<x-tab>
</x-tab>94.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>61<x-tab>
</x-tab>C1016<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5.3<x-tab> </x-tab>133.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>237<x-tab> </x-tab>RM349<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>1.3<x-tab> </x-tab>138.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>236<x-tab> </x-tab>RM348<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>13.2<x-tab> </x-tab>140.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>26<x-tab>
</x-tab>RG620<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>153.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>153.5<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>11<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-400.88<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c5<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>33<x-tab>
</x-tab>RZ390<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>30.1<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>104<x-tab> </x-tab>R2232<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.9<x-tab> </x-tab>30.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>93<x-tab>
</x-tab>R569<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>28.3<x-tab>
</x-tab>45<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>2<x-tab>
</x-tab>RG13<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>17.3<x-tab> </x-tab>73.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>55<x-tab>
</x-tab>C624<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>12<x-tab>
</x-tab>90.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>41<x-tab>
</x-tab>C43<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>13<x-tab>
</x-tab>102.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>31<x-tab>
</x-tab>RZ70<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.8<x-tab> </x-tab>115.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>251<x-tab>
</x-tab>RM26<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>24.1<x-tab> </x-tab>130.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>4<x-tab>
</x-tab>RG119<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5.3<x-tab> </x-tab>154.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>16<x-tab>
</x-tab>RG346<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>159.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>159.8<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>10<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-426.4<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c6 framework:<br>
<span
></span> <br>
<x-tab> </x-tab>
Markers<x-tab> </x-tab>Distance<br>
<x-tab> </x-tab> 42
C76 <x-tab>
</x-tab>
2.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab>
0<br>
<x-tab> </x-tab> 35
RZ516 30.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab>
2.4<br>
<x-tab> </x-tab>110
E12M36.1 12.0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab>
32.5<br>
<x-tab> </x-tab> 12
RG213 7.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab>
44.5<br>
<x-tab> </x-tab>248 MRG6488
41.9<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab> 51.8<br>
<x-tab> </x-tab>127 E12M36.18
8.4<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab> 93.7<br>
<x-tab> </x-tab>107
R2654 26.3<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>102.1<br>
<x-tab> </x-tab>135
E12M37.7 4.0<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>128.4<br>
<x-tab> </x-tab>134
E12M37.6 1.6<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>132.4<br>
<x-tab> </x-tab> 29
RG778 3.4<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>134.0<br>
<x-tab> </x-tab> 36 RZ682
----------<br>
<span
></span> 137.4 cM
11 markers log-likelihood= -360.56<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c7<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>62<x-tab>
</x-tab>C1057<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>17.8<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>247<x-tab> </x-tab>L538T7<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>26.7<x-tab> </x-tab>17.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>218<x-tab>
</x-tab>E12M39.11<x-tab>
</x-tab>6.5<x-tab>
</x-tab>44.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>79<x-tab>
</x-tab>G338<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>4<x-tab>
</x-tab>51<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>40<x-tab>
</x-tab>C39<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5.8<x-tab>
</x-tab>55<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>71<x-tab>
</x-tab>G89b<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>4.4<x-tab>
</x-tab>60.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>100<x-tab> </x-tab>R1440<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.4<x-tab>
</x-tab>65.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>64<x-tab>
</x-tab>G20<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>22.3<x-tab> </x-tab>67.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>50<x-tab>
</x-tab>C451<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>22.9<x-tab> </x-tab>89.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>99<x-tab>
</x-tab>R1357<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>19<x-tab>
</x-tab>112.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>27<x-tab>
</x-tab>RG650<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>18.9<x-tab> </x-tab>131.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>238<x-tab> </x-tab>RM234<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.5<x-tab> </x-tab>150.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>52<x-tab>
</x-tab>C507<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>14.5<x-tab> </x-tab>165.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>142<x-tab>
</x-tab>E12M37.14<x-tab>
</x-tab>2.5<x-tab> </x-tab>179.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>120<x-tab>
</x-tab>E12M36.12<x-tab>
</x-tab>3.8<x-tab> </x-tab>182.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>17<x-tab>
</x-tab>RG351<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>186<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>185.9<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>16<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-531.39<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c8<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>97<x-tab>
</x-tab>R902<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>15.4<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>116<x-tab>
</x-tab>E12M36.7<x-tab>
</x-tab>7.1<x-tab>
</x-tab>15.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>83<x-tab> </x-tab>G1010b<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>6.6<x-tab>
</x-tab>22.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>48<x-tab>
</x-tab>C225<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>1.7<x-tab>
</x-tab>29.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>138<x-tab>
</x-tab>E12M37.10<x-tab>
</x-tab>2.6<x-tab>
</x-tab>30.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>156<x-tab>
</x-tab>E18M43.4<x-tab>
</x-tab>11.3<x-tab> </x-tab>33.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>88<x-tab>
</x-tab>G2132<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>11.7<x-tab> </x-tab>44.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>84<x-tab>
</x-tab>G1073<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>19.7<x-tab> </x-tab>56.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>77<x-tab>
</x-tab>G187<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2<x-tab>
</x-tab>76.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>108<x-tab> </x-tab>R2676<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>13.4<x-tab> </x-tab>78.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>91<x-tab>
</x-tab>R202<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>20.4<x-tab> </x-tab>91.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>25<x-tab>
</x-tab>RG598<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.5<x-tab> </x-tab>111.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>96<x-tab>
</x-tab>R662<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>114.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>114.2<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>13<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-380.4<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c9<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>98<x-tab>
</x-tab>R1164<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>8.6<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>102<x-tab> </x-tab>R1687<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>19.2<x-tab>
</x-tab>8.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>89<x-tab>
</x-tab>R79<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>26.2<x-tab> </x-tab>27.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>80<x-tab>
</x-tab>G385<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>9.7<x-tab>
</x-tab>54<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>209<x-tab>
</x-tab>E12M39.1<x-tab>
</x-tab>5.4<x-tab>
</x-tab>63.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>246<x-tab> </x-tab>RM242<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>15.3<x-tab> </x-tab>69.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>181<x-tab>
</x-tab>E18M43.26<x-tab>
</x-tab>21.5<x-tab> </x-tab>84.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>122<x-tab>
</x-tab>E12M36.13<x-tab>
</x-tab>3.2<x-tab> </x-tab>105.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>86<x-tab>
</x-tab>G1085<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>4.1<x-tab> </x-tab>109.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>180<x-tab>
</x-tab>E18M43.25<x-tab>
</x-tab>5.4<x-tab> </x-tab>113.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>113<x-tab>
</x-tab>E12M36.4<x-tab>
</x-tab>17.2<x-tab> </x-tab>118.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>51<x-tab>
</x-tab>C506<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>135.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>136<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>12<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-406.24<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c10<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>57<x-tab>
</x-tab>C701<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>7.9<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>73<x-tab>
</x-tab>G89d<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>33.8<x-tab>
</x-tab>7.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>14<x-tab>
</x-tab>RG257<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>16.1<x-tab> </x-tab>41.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>130<x-tab>
</x-tab>E12M37.2<x-tab>
</x-tab>9.2<x-tab>
</x-tab>57.8<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>85<x-tab>
</x-tab>G1082<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>40.4<x-tab>
</x-tab>67<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>39<x-tab>
</x-tab>C16<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>35.7<x-tab> </x-tab>107.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>47<x-tab>
</x-tab>C223<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>143.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>143.2<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>7<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-321.71<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c11<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>95<x-tab>
</x-tab>R642<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>26.1<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>32<x-tab>
</x-tab>RZ141<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>11.5<x-tab> </x-tab>26.1<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>175<x-tab>
</x-tab>E18M43.z<x-tab>
</x-tab>5.1<x-tab>
</x-tab>37.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>111<x-tab>
</x-tab>E12M36.2<x-tab>
</x-tab>3.5<x-tab>
</x-tab>42.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>78<x-tab>
</x-tab>G320<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>8.8<x-tab>
</x-tab>46.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>230<x-tab>
</x-tab>E15M35.14<x-tab>
</x-tab>2.5<x-tab>
</x-tab>55<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>67<x-tab>
</x-tab>G44<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.7<x-tab>
</x-tab>57.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>124<x-tab>
</x-tab>E12M36.15<x-tab>
</x-tab>3.8<x-tab>
</x-tab>60.2<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>149<x-tab>
</x-tab>E12M45.y<x-tab>
</x-tab>10.5<x-tab>
</x-tab>64<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>255<x-tab> </x-tab>RM229<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab>74.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>1<x-tab>
</x-tab>RG2<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>20.1<x-tab> </x-tab>74.5<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>253<x-tab> </x-tab>RM206<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>2.8<x-tab>
</x-tab>94.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>46<x-tab>
</x-tab>C189<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>10.2<x-tab> </x-tab>97.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>115<x-tab>
</x-tab>E12M36.6<x-tab>
</x-tab>5.4<x-tab> </x-tab>107.6<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>87<x-tab>
</x-tab>G1465<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>5.7<x-tab>
</x-tab>113<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>140<x-tab>
</x-tab>E12M37.12<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>118.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>118.9<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>16<x-tab> </x-tab>markers<x-tab>
</x-tab>log-likelihood=<x-tab> </x-tab>-439.99<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c12t<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>244<x-tab> </x-tab>RM20A<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>4.9<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab></font></blockquote>
<blockquote type="cite" cite><font
face="Courier New"><x-tab>
</x-tab>65<x-tab>
</x-tab>G24<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>9.4<x-tab>
</x-tab>4.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>38<x-tab> </x-tab>CDO127<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>6.7<x-tab>
</x-tab>14.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>141<x-tab>
</x-tab>E12M37.13<x-tab>
</x-tab>4<x-tab>
</x-tab>21<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>240<x-tab> </x-tab>RM247<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>4.9<x-tab>
</x-tab>25<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>74<x-tab>
</x-tab>G124<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>29.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>30<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>6<x-tab>
</x-tab>markers<x-tab> </x-tab>log-likelihood=<x-tab>
</x-tab>-183.87<br>
<x-tab> </x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
c12b<x-tab>
</x-tab>framework:<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<br>
<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Markers<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>Distance<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>94<x-tab>
</x-tab>R617<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>3.7<x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>15<x-tab>
</x-tab>RG341<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>3.7<x-tab>
</x-tab>3.7<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>123<x-tab>
</x-tab>E12M36.14<x-tab>
</x-tab>8.6<x-tab>
</x-tab>7.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>103<x-tab> </x-tab>R1933<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>9.9<x-tab>
</x-tab>16<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>49<x-tab>
</x-tab>C449<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>19.5<x-tab> </x-tab>25.9<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>24<x-tab>
</x-tab>RG543<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>28.9<x-tab> </x-tab>45.4<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>9<x-tab>
</x-tab>RG181<x-tab>
</x-tab><x-tab>
</x-tab>0<x-tab>
</x-tab>74.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>59<x-tab>
</x-tab>C901<x-tab>
</x-tab>----------<x-tab>
</x-tab>74.3<x-tab>
</x-tab><x-tab> </x-tab><br>
<x-tab>
</x-tab>74.4<x-tab>
</x-tab>cM<x-tab>
</x-tab>8<x-tab>
</x-tab>markers<x-tab> </x-tab>log-likelihood=<x-tab>
</x-tab>-257.02<br>
<x-tab> </x-tab></font></blockquote>
<blockquote type="cite" cite><br>
Attachment converted: Macintosh HD:Bala x Azucena.doc (WDBN/MSWD)
(0003D642)<br>
<br>
------------<br>
Adam Price<br>
Lecturer in Plant Molecular Genetics<br>
School of Biological Sciences<br>
(Department of Plant and Soil Science)<br>
University of Aberdeen<br>
Aberdeen AB24 3UU, UK<br>
Tel; 01224 272690 Fax; 01224 272703<br>
e.mail a.price@abdn.ac.uk</blockquote>
<div><br></div>
<div><br></div>
<x-sigsep><pre>--
</pre></x-sigsep>
<div>******************************************<br>
Susan McCouch<br>
Dept of Plant Breeding<br>
418 Bradfield Hall<br>
Cornell University<br>
Ithaca, NY 14853-1901<br>
Phone: 607-255-0420<br>
Fax: 607-255-6683<br>
E-Mail: srm4@cornell.edu<br>
<br>
******************************************</div>
</body>
</html>