<html><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">
<div>Hi,</div><div><br class="webkit-block-placeholder"></div><div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">We first found this 'NULL' domain type in our mirrored version 26. There are two things we see that is strange.</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">1. There are dozens of Arabidopsis genes associated with the 'NULL' protein domain that according to InterPro is not a valid domain. <a href="http://www.gramene.org/Arabidopsis_thaliana/domainview?domainentry=NULL"><font color="#0000eb" style="color: #0000eb"><u>http://www.gramene.org/Arabidopsis_thaliana/domainview?domainentry=NULL</u></font></a></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">2. If one of the peptides is selected with a 'NULL' domain the protview page lists what apppears to be ALL protein domains, not just the ones assigned to the particular protein. Here is an example; <a href="http://www.gramene.org/Arabidopsis_thaliana/protview?transcript=AT1G02405.1-TAIR;db=core"><font color="#0000eb" style="color: #0000eb"><u>http://www.gramene.org/Arabidopsis_thaliana/protview?transcript=AT1G02405.1-TAIR;db=core</u></font></a></font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">We assume there is some small systematic error with assignments of protein domains. Do you anticipate a patched dataset for this version or will you wait until version 27 to fix it? Thanks</font></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; font: normal normal normal 12px/normal Helvetica; min-height: 14px; "><br></div><div style="margin-top: 0px; margin-right: 0px; margin-bottom: 0px; margin-left: 0px; "><font face="Helvetica" size="3" style="font: 12.0px Helvetica">Greg Brown</font></div> </div></body></html>