<!doctype html public "-//W3C//DTD W3 HTML//EN">
<html><head><style type="text/css"><!--
blockquote, dl, ul, ol, li { padding-top: 0 ; padding-bottom: 0 }
 --></style><title>New Gramene Release</title></head><body>
<div><font face="Arial">Gramene is proud to announce the release #22
of Gramene. For detailed information on the newest updates, please see
the release notes at&nbsp;
http://www.gramene.org/documentation/release_notes/releasenotes22.htm<span
></span>l.</font></div>
<div><font face="Arial"><br></font></div>
<div><font face="Arial"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Genomes: In an effort to
improve navigation through the web-site, there are significant changes
to the page layout at Gramene's Genomes module.</font><font
face="Arial"> Get an overview of this module with the Genomes tutorial
at www.gramene.org/tutorials/genomes.html.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Maps: Changes to the Maps
search view simplify your map search, and additional maps are now
available.&nbsp;</font><font face="Arial"> With significant changes to
the user interface, and more options available for viewing the maps,
we encourage you to review the user tutorial at
www.gramene.org/tutorials/cmap.html.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Markers: In addition to an
increase in marker information, the new detail information layout uses
tabbed navigation to minimize scrolling through long pages of
information, putting information right at your fingertips</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Proteins: In addition to
additional data, the Proteins database now has an advanced search and
links to the TIGR rice gene models for a best match.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Ontologies: The Ontologies
database has grown with additional information, and has a few minor
changes in the display.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Genes: Several hundred genes
have map positions on commonly used genetic maps, as well as the
Gramene annotated Nipponbare Sequence 2006. In addition, the detail
view for a gene has been enhanced to provide more
information.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">QTL: Additions include
information from O. Sativa crosses with wild relatives, as well as
Sorghum QTL.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Pathways: With addition
pathways added since the first release, we now present RiceCyc version
1.1.</font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000"><br></font></div>
<div><font face="Arial" color="#000000">Diversity: There has been
significant growth of the Diversity database, and a review this
module's tutorial can provide a quick overview to navigation
(www.gramene.org/tutorials/diversity.html).</font></div>
<div><font face="Arial"><br></font></div>
<x-sigsep><pre>-- 
</pre></x-sigsep>
<div><font color="#000000"><br></font></div>
<div><font size="-4" color="#000000">Sincerely,</font></div>
<div><font size="-4" color="#000000">The Gramene Database
Team</font></div>
<div><font size="-4" color="#000000"><br></font></div>
<div><font size="-4" color="#000000"><br></font></div>
<div><font size="-4"
color="#000000"
>*****************************************************************</font
></div>
<div><font color="#000000">Gramene(www.gramene.org) is a curated,
open-source, web-accessible data resource for comparative genome
analysis in the grasses. Our goal is to facilitate the study of
cross-species homology relationships using information derived from
public projects involved in genomic and EST sequencing, protein
structure and function analysis, genetic and physical mapping,
interpretation of biochemical pathways, gene and QTL localization and
descriptions of phenotypic characters and mutations.</font></div>
<div><font size="-4" color="#000000"><br>
*****************************************************************<br>
This work is funded by the National Science Foundation (NSF) and
the<br>
USDA-Agricultural Research Service, and was previously funded by the
USDA<br>
Initiative for Future Agriculture and Food Systems (IFAFS). We are
thankful<br>
to numerous collaborators and contributors for help in curation and
for<br>
sharing their datasets and tools.</font></div>
<div><font size="-4" color="#000000"><br>
*****************************************************************</font
></div>
<div><font size="-4" color="#000000">The Gramene-announce listserve is
used to notify registered users of<br>
timely information concerning Gramene (www.gramene.org) or the
rice<br>
community. If you want to unsubscribe from this mailing list, you
can<br>
send mail to &lt;</font><font size="-4"
color="#1103FF">Majordomo@brie4.cshl.org</font><font size="-4"
color="#000000">&gt; with the following command in<br>
the body of your email message: unsubscribe gramene-announce<br>
This mailing list is only for announcements by Gramene developers.<br>
To correspond with Gramene developers and users, subscribe to the<br>
gramene list by sending an email to</font><font size="-4"
color="#1103FF"> majordomo@gramene.org</font><font size="-4"
color="#000000"> and in the body</font></div>
<div><font size="-4" color="#000000">of the e-mail (not the subject
line) write: &nbsp;subscribe gramene . You may also contact the
Gramene team through the &quot;Feedback&quot; button at the top of the
Gramene website.</font></div>
</body>
</html>