<html>
<body>
Hi Lincoln, Jeremy, and Dave, <br><br>
Ok. We cheated a little without using PHP::Interpreter to at least
incorporate a header that we use in MaizeGDB:<br><br>
header = &lt;iframe width=&quot;100%&quot; frameborder=&quot;0&quot;
height=&quot;90&quot;
src=&quot;http://someaddress.edu/header.php&quot;&gt;
&lt;/iframe<br><br>
TUTORIAL?<br>
It turns out I don't even know how to create a &quot;Hello World!&quot;
perl code inside sub { .. } Is there a tutorial for dummies that shows
how to do this? I think this will be the first step for me before using
PhP::Interpreter.<br><br>
But for the time being we will be using Javascript for our other needs
(like creating a feedback button that includes the information where we
are in the genome along with the user comments) <br><br>
Thanks,<br>
Taner<br><br>
At 11:04 AM 9/30/2008, Lincoln Stein wrote:<br>
<blockquote type=cite class=cite cite="">Hi Taner,<br><br>
I don't have any experience with PHP::Interpreter myself, but I would be
very interested in how well this works. It might actually be easier to
embed GBrowse as an &lt;embed&gt; in a .php file.<br><br>
Lincoln<br><br>
On Mon, Sep 29, 2008 at 10:12 AM, Taner Z. Sen
&lt;<a href="mailto:taner@iastate.edu">taner@iastate.edu</a>&gt;
wrote:<br>

<dl>
<dd>Thanks Dave. That'll do.<br><br>

<dd>Given your great enthusiasm for PhP, we will give a shot to rewrite
our code in perl as you suggested.<br><br>

<dd>Taner<br><br>
<br>

<dd>At 05:28 PM 9/26/2008, Dave Clements, GMOD Help Desk wrote:<br>
<blockquote type=cite class=cite cite="">
<dd>Hi Taner,<br><br>

<dd>The thought of running PHP inside Perl gives me the cold
pricklies.<br>

<dd>However, that doesn't mean it can't be done.<br><br>

<dd>You could try something like PHP::Interpreter:<br><br>

<dd>&nbsp;
<a href="http://search.cpan.org/%7Egschloss/PHP-Interpreter-1.0.1/lib/PHP/Interpreter.pm">
http://search.cpan.org/~gschloss/PHP-Interpreter-1.0.1/lib/PHP/Interpreter.pm</a>
 <br>

<dd>&nbsp;
<a href="http://www.linuxjournal.com/article/9282" eudora="autourl">
http://www.linuxjournal.com/article/9282</a><br><br>

<dd>However, I don't think we would enthusiastically support doing
this.<br>

<dd>If at all possible I would think about rewriting the code in
Perl.<br><br>

<dd>Thanks,<br>

<dd>Dave C.<br>

<dd>GMOD Help Desk<br><br>
<br>

<dd>On Fri, Sep 26, 2008 at 3:21 PM, Taner Z. Sen
&lt;<a href="mailto:taner@iastate.edu">taner@iastate.edu</a>&gt;
wrote:<br>

<dd>&gt; Hi,<br>

<dd>&gt;<br>

<dd>&gt; Is there a way to insert php code in the conf file? (something
like header =<br>

<dd>&gt; &lt;?PHP&nbsp; ...)<br>

<dd>&gt;<br>

<dd>&gt; Thanks,<br>

<dd>&gt; Taner</blockquote>
<x-sigsep><p></x-sigsep>

</dl>Taner Z. Sen, Ph.D.<br>
Computational Biologist, USDA-Agricultural Research Service<br>
Collaborator Assistant Professor, Dept. of Genetics, Development and Cell
Biology<br>
Bioinformatics and Computational Biology Program<br>
Iowa State University<br>
1025 Crop Genome Informatics Lab<br>
Ames, IA 50011<br>
Phone: (515) 294-5326<br>
Fax: (515) 294-8280 <br>
<a href="mailto:taner@iastate.edu">taner@iastate.</a>
<a href="mailto:taner@iastate.edu">edu</a> <br>
<a href="http://www.public.iastate.edu/~taner/" eudora="autourl">
http://www.public.iastate.edu/~taner/</a> </body>
</html>