<div>Hi,</div>
<div>&nbsp;</div>
<div>I&#39;m a post-doctoral fellow in bioinformatics and my lab is about to receive data generated from a massively parallel sequencing platform --&nbsp; Illumina&#39;s genome analyzer.&nbsp; The data will contain several million short sequence reads from mRNA and microRNA.&nbsp; There are several software packages to align the reads to the human genome, but I will need to create a way to store, filter, and efficiently annotate these reads.&nbsp; I&#39;m thinking of loading the data into a chado database, and using applications such as GBrowse to view the data.&nbsp; I&#39;m wondering if you have any experience with using GMOD software/applications for this type of data?&nbsp; I&#39;m wondering if the data will be too extensive to be queried in a database?&nbsp; If you have any advice/suggestions I would really appreciate it.</div>

<div>&nbsp;</div>
<div>Thank you very much,</div>
<div>Jennifer Beane, Ph.D</div>
<div>Post-doctoral Fellow</div>
<div>Boston University School of Medicine</div>