<div dir="ltr"><div>Dear Fuchao,<br><br>According to the gene annotation we did via an automated, evidence-based method called GeneFinder, this is the case. The sequence for GRMZM2G010855_T01 corresponds to a transposon.<br><br></div><div>Best,<br><br></div>Marcela<br></div><div class="gmail_extra"><br><div class="gmail_quote">On Tue, Dec 30, 2014 at 3:19 AM, <a href="mailto:feedback@gramene.org">feedback@gramene.org</a> <span dir="ltr">&lt;<a href="mailto:feedback@gramene.org" target="_blank">feedback@gramene.org</a>&gt;</span> wrote:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0 0 0 .8ex;border-left:1px #ccc solid;padding-left:1ex">URL         : <a href="http://gramene.org/blog" target="_blank">http://gramene.org/blog</a><br>
<br>
Subject     : Site Feedback: transposon<br>
<br>
Name        : Fuchao Jiao<br>
<br>
Email       : <a href="mailto:fuchao.jiao@bio.kuleuven.be">fuchao.jiao@bio.kuleuven.be</a><br>
<br>
Organization: KU Leuven<br>
<br>
Comments    :<br>
<br>
Hello,<br>
In my experiments of cloning maize genes from B73 cDNA libary, i got a fragment about 1200bp,which encode 396aa,through blast assay in gramene  website, i found that it is one part of GRMZM2G010855_T01,which is a transposable element in website.and my fragment sequence is very  similar to the gene BT084605(NCBI accession number),so i wonder it is really a transposon.thanks!<br>
<br>
<br>
<a href="http://www.warelab.org/bugs/view.php?id=5089" target="_blank">http://www.warelab.org/bugs/view.php?id=5089</a><br>
<br>
<br>
_______________________________________________<br>
Feedback mailing list<br>
<span class="HOEnZb"><font color="#888888"><a href="mailto:Feedback@gramene.org">Feedback@gramene.org</a><br>
<a href="http://brie4.cshl.edu/mailman/listinfo/feedback" target="_blank">http://brie4.cshl.edu/mailman/listinfo/feedback</a><br>
</font></span></blockquote></div><br></div>